Mapeo del genoma humano: $200, 2 días, el doble de rápido

Illumina dice que su máquina NovaSeq X reducirá el precio de la secuenciación a $200 por genoma humano. CORTESÍA DE ILLUMINA
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A medida que el precio baje y la velocidad aumente, habrá un momento en los próximos años en el que el genoma de todos pueda mapearse y almacenarse. Este es un paisaje de ensueño transhumanista porque analizar y comparar la estructura genética de todos sería una mina de oro de datos, que se vería como un camino hacia la inmortalidad. ⁃Editor de TN

El genoma humano está compuesto por más de 6 mil millones de letras, y cada persona tiene una configuración única de A, C, G y T, los componentes básicos moleculares que forman el ADN. Determinar la secuencia de todas esas letras solía requerir grandes cantidades de dinero, tiempo y esfuerzo. El Proyecto Genoma Humano tomó 13 años y miles de investigadores. El costo final: $ 2.7 mil millones.

Ese proyecto de 1990 inició la era de la genómica, ayudando a los científicos a desentrañar los impulsores genéticos del cáncer y muchas enfermedades hereditarias mientras estimula el desarrollo de pruebas de ADN en casa, entre muchos otros avances. Luego, los investigadores comenzaron a secuenciar más genomas: de animales, plantas, bacterias y virus. Hace diez años, a los investigadores les costaba alrededor de $10,000 secuenciar un genoma humano. Hace unos años, eso cayó a $1,000. Hoy en día, es alrededor de $ 600.

Ahora, la secuenciación está a punto de abaratarse aún más. Un bronceado evento de la industria En San Diego, el gigante de la genómica Illumina presentó hoy lo que llama sus máquinas de secuenciación más rápidas y rentables hasta el momento, la serie NovaSeq X. La compañía, que controla alrededor del 80 por ciento del mercado de secuenciación de ADN a nivel mundial, cree que su nueva tecnología reducirá el costo a solo $ 200 por genoma humano y proporcionará una lectura al doble de velocidad. Francis deSouza, director ejecutivo de Illumina, dice que el modelo más poderoso podrá secuenciar 20,000 7,500 genomas por año; sus máquinas actuales pueden hacer unas XNUMX. Illumina comenzará a vender las nuevas máquinas hoy y las enviará el próximo año.

“Mientras miramos hacia la próxima década, creemos que estamos entrando en la era de la medicina genómica que se generaliza. Hacer eso requiere la próxima generación de secuenciadores”, dice deSouza. “Necesitamos que los puntos de precio sigan bajando para que la medicina genómica y las pruebas genómicas estén disponibles de manera mucho más amplia”.

La secuenciación ha llevado a medicamentos genéticamente dirigidos, análisis de sangre que pueden detectar el cáncer tempranoy diagnósticos de personas con enfermedades raras que han buscado respuestas durante mucho tiempo. También podemos agradecer a la secuenciación por la Vacunas para COVID-19, que los científicos comenzaron a desarrollar en enero de 2020 tan pronto como se produjo el primer plano del genoma del virus. En los laboratorios de investigación, la tecnología se ha vuelto esencial para comprender mejor los patógenos y la evolución humana. Pero todavía no es omnipresente en la medicina. Eso es en parte debido a la etiqueta de precio. Si bien a los científicos les cuesta alrededor de $ 600 realizar la secuenciación, la interpretación clínica y el asesoramiento genético pueden aumentar el precio a unos miles de dólares para los pacientes, y el seguro no siempre lo cubre.

Otra razón es que, para las personas sanas, todavía no hay suficiente evidencia de los beneficios para demostrar que la secuenciación del genoma valdrá la pena. Actualmente, la prueba se limita principalmente a personas con ciertos tipos de cáncer o enfermedades no diagnosticadas, aunque en dos estudios recientes, alrededor 12 a 15 por ciento de las personas sanas cuyos genomas fueron secuenciados terminaron teniendo una variación genética que mostró que tenían un riesgo elevado de una enfermedad tratable o prevenible, lo que indica que la secuenciación puede proporcionar una alerta temprana.

Por ahora, los investigadores, no los pacientes, probablemente se beneficiarán más de la secuenciación económica. “Hemos estado esperando esto durante mucho tiempo”, dice Stacey Gabriel, directora de genómica del Instituto Broad del MIT y Harvard, sobre las nuevas mejoras. "Con costos muy reducidos y una velocidad de secuenciación mucho mayor, podemos secuenciar muchas más muestras". Gabriel no está afiliado a Illumina, pero el Instituto Broad es algo así como un usuario avanzado de Illumina. El instituto cuenta con 32 de las máquinas existentes de la empresa y ha secuenciado más de 486,000 genomas desde su creación en 2004.

Gabriel dice que hay varias formas en que los investigadores podrán aplicar un poder de secuenciación adicional. Una es aumentar la diversidad de conjuntos de datos genómicos, dado que la gran mayoría de los datos de ADN han provienen de personas de ascendencia europea. Ese es un problema para la medicina, porque diferentes poblaciones pueden tener diferentes variaciones genéticas que causan enfermedades que son más o menos frecuentes. “Realmente hay una imagen incompleta y una capacidad limitada para traducir y aplicar esos aprendizajes a la diversidad de la población total del mundo”, dice Gabriel.

Otra es aumentar el tamaño de los conjuntos de datos genéticos. A principios de la década de 2000, cuando el Instituto Broad inició un proyecto para buscar genes relacionados con la esquizofrenia, los investigadores tenían 10,000 150,000 genomas de personas con la afección, lo que no arrojó mucha información, dice Gabriel. Ahora, han acumulado más de XNUMX.

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Acerca del Editor

Patrick Wood
Patrick Wood es un experto líder y crítico en Desarrollo Sostenible, Economía Verde, Agenda 21, Agenda 2030 y Tecnocracia histórica. Es autor de Technocracy Rising: The Trojan Horse of Global Transformation (2015) y coautor de Trilaterals Over Washington, Volumes I and II (1978-1980) con el fallecido Antony C. Sutton.
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Brian

Todo puede ser usado o bueno o malo. La historia de los humanos parece que la usamos para mal. armarlo. no lo entiendo pero tengo moral.